Jarod est toujours à la recherche de son père. Il s'en va le retrouver en Caroline du Nord où il s'est réfugié. Une fois arrivé là-bas, son père a disparu.
Jarod découvre l'existence d'un étrange projet Gemini financé par le Centre. Il apprend avec horreur que c'est un projet d'expérimentation sur le clonage, à partir de son propre ADN.
Pendant ce temps-là, Broots et Miss Parker tentent de retrouver ce projet Gémini. Il les mène dans un sous-sol du Centre, transformé en laboratoire d'expérimentation.
De son coté, Sydney va tout faire pour être le coordinateur de ce projet au grand étonnement de Mlle Parker et de Broots.
Jarod retrouve enfin son père et ils décident ensemble de tout tenter pour récupérer son clone mais le Major Charles va se faire capturer par le Centre. Jarod et son clone vont alors kidnapper Mr Parker pour l'échanger contre le Major Charles.
Sydney va alors livrer le Major à Jarod, mais au même moment un tireur vise Mr Parker mais c'est sa fille qui va prendre la balle en tentant de le protéger. Jarod reste sur place et dit à son père de partir avec le clone, mais lorsque Jarod tente de s'enfuir, le Centre le capture.